Кафедра инженерной экологии создана в 1946 году как кафедра горного дела. Она была первой на организованном в то время горном факультете Киевского политехнического института, главной целью являлась подготовка специалистов для горной промышленности Украины, которая после войны требовала полного восстановления, особенно в новых перспективных западных регионах Украины.
В 1948 году кафедру переименовали в кафедру разработки месторождений полезных ископаемых. Новое название больше соответствовало направлению учебной работы и просуществовала до 1963 года. Kафедра разработки месторождений полезных ископаемых выполняла не только функции выпускающей, но и обеспечивала горно-технологическую подготовку студентов других кафедр факультета: шахтного строительства, горной электромеханики, геологии.
В 1958-1963 годах произошло объединение с кафедрой горных машин и рудного транспорта и переименование кафедры в кафедру технологии и механизации горных работ. В целом период 1946-1960 годов характеризуется формированием научно-педагогического коллектива кафедры, началом и развитием научной школы, укреплением связей кафедры с горнодобывающей промышленностью, научными и проектными организациями, высшими учебными заведениями страны, наконец, созданием той педагогической и научной атмосферы кафедры, присущей Киевскому политехническому институту.
С конца 60-х годов научные исследования выполнялись для шахт угольных разрезов, карьеров добычи строительных материалов, строительных организаций. Диапазон этих организаций постоянно расширялся: тресты «Павлоградуголь», «Нововолынскуголь», «Шахтерскантрацит», «Донецкантрацит», «Луганскуголь», «Приморскуголь», «Александрияуголь», «Камчаткаэлектросетьбуд», Колымская ГЭС, «Тюменьнафтогаз» и другие. Тогда же сформировались научные направления кафедры: создание эффективных технологий и схем механизации горных работ; создание систем управления технологическими процессами; изучение физико-механических свойств горных пород и создание инструмента для их разрушения. В последующие годы спектр научных поисков расширился, что способствовало укреплению аспирантуры кафедры по специальностям: «Подземная разработка месторождений полезных ископаемых», «Открытая разработка полезных ископаемых», «Горные машины».
В 1991 году кафедра переименована в кафедру геотехнологии и инженерной экологии. Этот период деятельности кафедры характеризуется созданием филиалов кафедры в ПО «Гранит», «Киевнерудпром» и «Закарпатнерудпром», в Институте гидромеханики НАН Украины, выпусками горных инженеров заочной формы обучения для предприятий промышленности строительных материалов. Структурные изменения, коснувшиеся кафедры, положительно отразились на характере учебной и научной работы, которая больше сосредоточилась на технологических и экологических направлениях.
Укреплению экологического направления способствовало создание в 1995 году межотраслевой учебной и научной экологической лаборатории Минобразования, Минуглепрома и Государственной корпорации «Укрстройматериалы». В 1995 году открыта специальность «Экологические технологии и оборудования в горном деле». Обучение на кафедре осуществлялось по трем специальностям: «Экологические технологии и оборудования в строительстве», «Открытые горные работы», «Технология и оборудования добычи строительных горных пород» с рядом специализаций. В 1996 году состоялся первый выпуск бакалавров горного дела в системе трехступенчатой подготовки: бакалавр, специалист, магистр.
В 2000 году кафедра геотехнологии и инженерной экологии переименована в кафедру инженерной экологии. Меняется профиль подготовки специалистов, начинается переход на новую специальность — «Экология и охрана окружающей среды». Несмотря на значительные трудности, связанные, в первую очередь, с совершенствованием учебно-методического обеспечения и формированием новой тематики дипломных работ, удалось сохранить высококвалифицированные кадры, способные решать текущие задачи и работать на перспективу.
В декабре 2011 года заведующим кафедрой единогласно избирается проф. Ткачук Константин Константинович. С 2016 года кафедра осуществляет набор по специальности 101 «Экология», специализация «Инженерная экология и ресурсосбережение».